EN

方向分析

新生实验室

字节跳动分拆的 AI 制药团队。对外以 Protenix 这套开源 AlphaFold3 复现为人所知,对内把结构预测、生成设计、亲和力与研发推理接成一条闭环引擎,管线里有 IL-17 与 IL-4R。

最近核实 AI4S.fyi 依据公开记录所做的解读,出处列在文末

核心判断

把结构预测、设计、亲和力与决策推理接进同一条由实验反馈驱动的引擎,可以显著降低候选分子的实验搜索量。

要让这条路径成立,需要被验证的是什么。

真正的瓶颈:团队把瓶颈放在两次实验之间的衔接:谁定表位、谁把几千个候选压到实验室能承受的数量、拿到测量之后改哪几个残基。这些步骤被写进同一条工作流,交给一个在对话里调度的智能体。

已经成立的部分:开源的结构预测(三篇预印本、权重可下载、外部可运行),以及一次有 SPR 实测、跑完两轮的抗体设计循环。

仍是主张的部分:“闭环引擎能加速药物发现”:一个未披露靶点、一种模态,报告把功能与可开发性评估列为后续步骤,也还没有 IND 或试验注册。

选择的产品抽象:对外是一条自有管线,对内是一个用自然语言驱动的科研界面,更接近给科学家的研究助理,而不是全自动实验室。

研究闭环怎么运行

运行顺序目标与表位选择生成式设计结构与亲和力评估湿实验测量(SPR)反馈驱动的优化[S1][S2]

AnewDDE 的四个组件 [S1][S2]
结构层 AnewFold抗体-抗原复合物、蛋白-配体、盲测口袋识别与分子胶三元复合物
定量层 AnewAffinity接近 FEP 精度的结合亲和力预测,并给出每次预测自身可靠性的估计
设计层 AnewDesign扩散生成、液相风险序列剔除与聚类,以及实验反馈驱动的亲和力成熟
决策层 AnewMind千亿参数模型,负责 ADMET 与可开发性分析、候选排序与长链条研发推理
界面 AnewScience科学家用自然语言描述目标,智能体调度上面四层并在每个分叉处请求确认

当前公开边界:结构预测、候选生成与结合力测量;功能活性、可开发性与任何临床节点都还没有公开。

  • 实验由人执行,智能体负责把决定变成可运行的计算任务。
  • 公开的 campaign 只有一个未披露靶点、一种模态。
  • 四个组件里只有更早的 Protenix 系列是外部可运行的。

已经公开展示了什么

内容证据类型来源
三篇结构预测预印本,署名 ByteDance Seed,权重可下载公开技术产物[S5][S6][S7]
纳米抗体 campaign:150 个克隆中 16 个经 SPR 测到 1.8-8.1 nM公司自述[S1][S2]
AnewFold 在三组抗体-抗原基准上的 Top-1 成功率与蛋白-配体结果公司自述[S1]
AnewMind 的 ADMET 评测与内部基准 PharmBench(200 道子题、17 个模型)公司自述[S1][S3]
口服 pan-IL-17 小分子在 AAI 与 FOCIS 的受邀口头报告公司自述[S8]
2.9 亿美元分拆融资,15 亿美元估值独立第三方[S9]

证据停在哪里

环节状态
开源、外部可运行的结构预测●
生成设计产出可测量的候选●
实验反馈进入下一轮设计◐
功能活性与可开发性数据○
独立第三方复现○
IND 申报或临床节点○

钱从哪里来

谁付费:自有管线为主,平台部分开源、部分内部;算力由火山引擎提供

为什么付费:结构预测、候选生成与筛选、亲和力预测、研发决策推理

什么形成可持续资产:这支团队的位置比较特别:一边用 Protenix 在结构预测社区积累了公开信誉,一边握着自己的管线。分拆之后,公开的重心正从模型权重转向技术报告。

目前能够确认的方向是:三篇署名 ByteDance Seed、权重开放的结构预测预印本(Protenix、v1、v2),一份把四个模型接成闭环引擎的技术报告(AnewDDE),一次针对未披露内部靶点、有 SPR 实测的纳米抗体 campaign,一批在会议上口头报告的 IL-17 小分子数据,以及一轮 2.9 亿美元的分拆融资。 这份记录有一个不常见的形状:早期最强的证据是公开的、可以被别人运行的;最新最完整的证据是内部的、只能通过技术报告读到。

范围说明: 本页只追踪公开记录:公司自己的发布与技术报告、预印本与会议信息,以及第三方报道。没有内部信息。它记录的是公开材料能走到哪一步,而不是这家公司做得好不好。


概览

方向能确认什么最新证据
1. 结构预测Protenix 三篇预印本,权重开放,外部可运行预印本,2026-04-11
2. 抗体设计150 个克隆里 16 个经 SPR 测到 1.8-8.1 nM公司研究页,2026-09-15
3. 亲和力与采样AnewAffinity 在 199 个配体上的排序相关性优于对照技术报告,2026-09-17
4. 决策层千亿参数模型,内部基准 PharmBench 共 200 道子题公司研究页,2026-09-15
5. 管线IL-17、IL-4R 与两个未披露靶点;IL-17 有会议数据会议报告,2026-06-09
6. 组织与资本2.9 亿美元、15 亿估值,字节跳动保留 56%路透社报道,2026-09-16

1. 结构预测:公开的那一半

能确认什么: 2025 年 1 月,ByteDance 发布 Protenix,一份 AlphaFold3 的完整复现,覆盖蛋白-配体、蛋白-蛋白与蛋白-核酸预测,权重与代码开放。2026 年 2 月的 Protenix-v1 称其为首个在相同训练数据截止、模型规模与推理预算下超过 AlphaFold3 的完全开源结构预测模型,并展示了推理时增加采样带来的稳定提升。2026 年 4 月的 Protenix-v2 报告抗体-抗原成功率相对 v1 最多提高 13 个百分点,5 个 seed 的表现超过此前 1000 个 seed 的结果,同时把系统扩展到生物分子设计。

这三篇都署名 ByteDance Seed,都能在 bioRxiv 上读到,权重也能下载。这是整份记录里外部最容易检验的一段。

它与 AnewFold 的关系需要说清楚。 AnewDDE 报告里的结构预测组件叫 AnewFold,报告称它在抗体-抗原界面的 Top-1 成功率为 AF3-AB 62.3%、PXMeter-AB 60.8%、FoldBench-AB 76.2%,在蛋白-配体的 FoldBench 集合上为 77.4%,对照包括 Protenix-v2 与 AlphaFold3。也就是说,它的对照对象里有团队自己此前的开源模型,而 AnewFold 本身目前不是公开可运行的。

边界: 结构与界面预测。可信度:Protenix 系列为高(预印本 + 开放权重 + 外部使用);AnewFold 的领先幅度为中(自评、模型未公开)。

待查线索: AnewFold 是否会像 Protenix 那样开源或投稿;第三方在自己选定的抗体-抗原集合上复现时,领先幅度还剩多少。


2. 抗体设计:一次跑完两轮的 campaign

能确认什么: AnewDesign 针对一个未披露的内部蛋白靶点做纳米抗体设计。流程从已发表的 VHH 结合体和一个公开晶体结构出发,由智能体检索文献与结构、提出候选表位,再启动扩散模型生成与结构预测评估。筛选阶段会剔除 CDR 区里与脱酰胺、断裂、异构化和 N-糖基化相关的高风险序列,并做聚类以保留多样性。

首轮 50 个克隆送进实验室,SPR 测出 7 个 K_D 在 46-390 nM 的结合体,命中率 14%。这批测量结果与可开发性标签被用作参考数据,通过部分扩散算法在保留已验证区域的前提下做定向优化;第二轮 100 条序列测下来,得到 16 个 1.8-8.1 nM 的候选。两轮合计 150 个克隆、16 个个位数纳摩尔,成功率 10.7%。

值得单独记下的是第二轮。 首轮的命中率在抗体发现里并不稀奇,真正的分界线是拿到实测数据之后能不能定向改进。两轮之间亲和力提高了约一个数量级,说明测量确实回到了设计里。同一张图上的阳性对照是 1.7 nM,优化后的候选与这个已有参照处在同一量级。

边界: 结合力。公司把功能活性与可开发性评估列为后续步骤。可信度:中(有实测数据,但靶点未披露、由公司自行报告)。

待查线索: 第二个靶点的 campaign;这批克隆的功能与可开发性数据;靶点难度的披露,因为有成熟晶体结构和已发表结合体可参考的靶点,和真正的硬骨头不是一回事。


3. 亲和力与采样:对标 FEP 的那条线

能确认什么: AnewAffinity 的目标是在接近自由能微扰(FEP)精度的同时跑得足够快,可以用于大规模筛选,并给出每次预测自身可靠性的估计。技术报告在 199 个配体上给出对照:配对 ΔΔG 的 RMSE 为 1.057 kcal/mol,加权 Pearson R² 为 0.553,Spearman 为 0.724;对照的 Boltz-2 分别是 1.016、0.486、0.620。

两个指标指向不同的结论。 按绝对误差看,Boltz-2 略好;按排序相关性看,AnewAffinity 明显更好。在实际项目里,决定先合成哪一个的通常是排序,所以这组数字读起来的意思是"更适合做优先级排序",而不是"更准"。

这条线还有两项更早的公开工作:2026 年 3 月的 AnewSampling(面向动力学感知的采样引擎)与 AnewOmni(全原子生成模型),以及在 2026 年 5 月巴塞罗那 Alchemistry 自由能工作坊上的受邀报告,题目是 Learning the Thermodynamic Landscape of Protein–Ligand Interactions at Scale。

边界: 计算预测。可信度:中(内部基准,对照方法公开,但评测由团队运行)。

待查线索: AnewAffinity 与真实 FEP 在同一组前瞻性项目上的对照;工作坊报告是否会形成论文。


4. 决策层:AnewMind 与 PharmBench

能确认什么: AnewMind 是一个千亿参数级别的内部大模型,经过全参数后训练,负责 ADMET 与可开发性分析、候选相对排序和长链条研发推理。公司报告它在四项 ADMET 与可开发性综合评估中都进入前五,在环肽膜透过性上排第一,抗体可开发性接近领先,同时在 MMLU-Pro 与 GPQA Diamond 等通用基准上没有明显退化。

为评估长链条决策,团队请药物研发专家围绕真实案例构建了内部基准 PharmBench:逐步释放项目背景与实验证据,看模型能否整合证据并作出研发判断,共 200 道子题、七个能力维度,比较了 17 个模型。

这类基准的价值和限制是同一件事。 它衡量的是真实研发场景里的判断,这正是公开基准稀缺的部分;但它由同一家公司设计、运行且尚未公开,外部无法复算。

边界: 分析与排序建议。可信度:中低(内部基准,未公开)。

待查线索: PharmBench 是否公开;AnewMind 的判断在多大程度上改变了项目的实际决定,而不只是被记录下来。


5. 管线:四个靶点,其中两个未披露

能确认什么: 公司官网列出四条管线:IL-17AA/AF/FF、IL-4R,以及两个未披露靶点,阶段图覆盖 Exploratory 到 IND Enabling。

IL-17 是其中公开信息最多的一条。2026 年 4 月的美国免疫学家协会(AAI)年会上,团队以受邀口头报告的形式介绍了由生成式 AI 设计的口服 pan-IL-17 小分子抑制剂,称其为首批对 IL-17F/F 二聚体实现强结合的小分子;6 月的 FOCIS 年会补充了体内数据,公司描述为"接近生物制剂的活性"。

会议报告的证据位置。 受邀口头报告要经过会议委员会评审,这与自行发布不同;但它仍然不是同行评审论文,公开材料里也没有化合物结构、剂量、动物模型细节或试验注册。

边界: 临床前。可信度:中(会议评审 + 公司描述);任何关于临床的推论为低。

待查线索: IL-17 项目的论文或专利公开;第一份 IND 申报;IL-4R 与两个未披露靶点的任何一手信息。


6. 组织与资本:从字节跳动分拆出来

能确认什么: 据路透社报道,2026 年 9 月 Anew Labs 完成 2.9 亿美元融资,估值 15 亿美元,字节跳动保留 56% 股份;HSG、IDG 资本与高瓴领投,5Y Capital 联合领投,其余参与方包括高榕、方源、博裕与上海未来产业基金,SBP Group 为战略投资方。报道称约 50 名核心成员转入新公司,算力仍由字节跳动的火山引擎提供。团队负责人为刘凯,公司在上海、新加坡与美国圣何塞设有办公室。

这次分拆改变了记录的形状。 团队最初的公开身份是 ByteDance Seed 的结构预测研究者,作品是开源模型;分拆之后,最新的成果以技术报告形式出现,AnewFold 与 AnewMind 都留在内部。这不是这一家公司的特例,但它让"哪些部分外部还能检验"这个问题在这份记录上尤其清楚。

边界: 资本与组织。可信度:高(多家媒体引述路透社,细节一致);但这是关于资本的证据,不是关于分子的证据。


找不到什么

  • AnewDDE 没有同行评审论文。 9 月那份是公司技术报告。
  • AnewFold、AnewAffinity 与 AnewMind 都不是公开可运行的模型。 可以外部运行的是更早的 Protenix 系列。
  • 抗体 campaign 的靶点未披露,因此外部无法判断任务难度。
  • 没有功能活性与可开发性数据,报告把它们列为后续评估步骤。
  • 没有 IND、试验注册或具名候选药物。
  • PharmBench 未公开,17 个被比较模型的名单与配置也未公开。

方法与范围

材料来自公司官网与研究页、AnewDDE 技术报告、三篇 Protenix 预印本的 Crossref 元数据与摘要,以及路透社经 The Next Web 转述的融资报道。上文引用的每一个数字都在其来源处读取过;技术报告的文本经解析后核对。

公司自报的性能在全文中都被明确标注。本页试图守住的区分是:什么是外部可以运行的(Protenix 系列)、什么是公司自己测出来的(AnewFold、AnewAffinity、AnewMind 的基准)、什么是有实测数据的(抗体 campaign 的 SPR 结果),以及什么目前只有名字(两个未披露靶点)。


一手来源

证据时间线

日期事件新证据它没有证明什么来源
AnewDDE 技术报告四个组件被接成一条闭环引擎:AnewFold 结构预测、AnewAffinity 亲和力、AnewDesign 生成设计、AnewMind 研发推理。报告同时给出抗体-抗原界面与蛋白-配体的基准结果。基准由团队自己运行,AnewFold 与 AnewMind 目前都不是公开可运行的模型。TECH REPORT · COMPANY-REPORTED ↗
AnewDesign:一次有实测的纳米抗体 campaign针对一个未披露的内部蛋白靶点:首轮 50 个克隆测出 7 个 46-390 nM 的结合体,用这批数据指导优化后,第二轮 16 个克隆达到 1.8-8.1 nM,两轮合计 150 个克隆、10.7%。SPR 测到的是结合力;功能活性、可开发性与靶点难度都还没有公开。RESEARCH PAGE · COMPANY-REPORTED ↗
分拆并完成 2.9 亿美元融资据路透社报道,估值 15 亿美元,字节跳动保留 56%,HSG、IDG 资本与高瓴领投,约 50 名核心成员转入新公司,算力仍由火山引擎提供。这条闭环能否在别的靶点和别的模态上复制,并把某个候选推到 IND?REPORTING · REUTERS ↗
Protenix-v2 预印本抗体-抗原成功率相对 v1 最多提高 13 个百分点,5 个 seed 的表现超过此前 1000 个 seed 的结果,并把系统扩展到生物分子设计。这条闭环能否在别的靶点和别的模态上复制,并把某个候选推到 IND?PREPRINT · PUBLIC ARTIFACT ↗
首个口服 pan-IL-17 小分子在 AAI 口头报告公司称这是首批对 IL-17F/F 二聚体实现强结合的小分子,6 月在 FOCIS 补充了体内数据,两场均为受邀口头报告。会议报告没有同行评审论文,也没有公开的化合物结构、剂量或试验注册。CONFERENCE · COMPANY-REPORTED ↗
Protenix-v1 预印本称其为首个在相同训练数据截止、模型规模与推理预算下超过 AlphaFold3 的完全开源结构预测模型,并展示推理时扩展带来的稳定提升。这条闭环能否在别的靶点和别的模态上复制,并把某个候选推到 IND?PREPRINT · PUBLIC ARTIFACT ↗
Protenix:AlphaFold3 的开源复现ByteDance 发布 AlphaFold3 的完整复现并开源,覆盖蛋白-配体、蛋白-蛋白与蛋白-核酸预测。这是团队在结构预测社区的起点。这条闭环能否在别的靶点和别的模态上复制,并把某个候选推到 IND?PREPRINT · PUBLIC ARTIFACT ↗

证据说明:CEO 主张 ≠ benchmark;benchmark ≠ 实体实验;实体实验 ≠ 制造放大;第三方测试 ≠ qualification;qualification ≠ 真实部署。每条证据都保留来源,并写明它支持什么、不能证明什么。

资料来源

  1. AnewDDE: An Agentic Drug Discovery Engine (technical report) · Company technology report
  2. AnewDesign: An Integrated Workflow for Antibody Design and Optimization · Company research page
  3. AnewMind: A Scientific Reasoning LLM for Drug Discovery Decisions · Company research page
  4. Anew Labs: platform, pipelines and teams · Company
  5. Protenix-v2: Broadening the Reach of Structure Prediction and Biomolecular Design · Preprint
  6. Protenix-v1: Toward High-Accuracy Open-Source Biomolecular Structure Prediction · Preprint
  7. Protenix - Advancing Structure Prediction Through a Comprehensive AlphaFold3 Reproduction · Preprint
  8. 2026 AAI Oral Presentation: First-in-Class Small-Molecule Pan-IL-17 Inhibitor · Conference
  9. ByteDance's AI drug unit Anew Labs raises $290M at $1.5B valuation · Third party reporting